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  • Cell Reports | 浙江大学方群团队联合浙大良渚实验室王永成和傅旭东团队实现深度单细胞转录组与蛋白质组分析新突破

    单细胞多组学(Single-cell multi-omics)技术是在单细胞单组学技术的基础上,实现在同一细胞中测量多种组学数据的前沿技术,Nature Methods杂志和中国科协曾将其列为2019年年度技术和20个重大科学问题及工程技术难题之一。单细胞多组学技术可以在单一细胞个体内,同时分析多个基因、蛋白质和小分子的表达情况,从而更全面地揭示细胞的状态和功能,有利于从遗传信息、信号调控、蛋白表达、代谢通路等多层面探究生命活动的奥秘以及疾病的发生、发展与治疗机制。蛋白质作为细胞生命活动的执行者,直接反映了细胞真实的生命活动状态,因此,发

  • Nature Chemistry | 顾宏周课题组与合作者开发MORAC技术用于发现低丰度区的生物标志物

    生物标志物是信息型分子、颗粒甚至于细胞,其在健康和病患人群间存在数量或质量上的明显差异。因此,生物标志物的发现和鉴定对于疾病的诊治具有重要的意义。但是,生物体系的高度复杂性及(疾病早期阶段)标志物的稀有性使得标志物的发现极具挑战。当前,以蛋白质组学为代表的组学类发现策略具有高通量的优点,而传统的基于亲和识别的生化类发现策略拥有较好的特异性,但两者均存在灵敏度不足的缺陷,难以在低丰度区高效地发现生物标志物,制约了我们对重大疾病发生发展过程中分子层面变化的深刻认知。

  • 细胞外多组学分析揭示胃肠道癌症患者潜在血液标志物

    液体活检在癌症早筛和预后监测方面有着得天独厚的优势。体液中的游离DNA(cfDNA)和游离RNA(cfRNA)在疾病诊断和预后的无创评估中已经有了深厚的研究积累。诸多cfDNA特征,例如突变、拷贝数、甲基化模式、片段化模式和核小体足迹在癌症患者中都发生着异常调控。许多 cfRNA 特征也可以作为癌症标志物(包括microRNA,circRNA以及 mRNA 和长非编码RNA 的选择性剪接模式)。不过,单组学特征各有所长,比如cfDNA的甲基化具有极佳的组织溯源能力,但是对于早期癌症患者的检出率较低。而cfRNA虽然丰度和灵敏性较高,与癌症患者的动态息息相关,但是 RNA的稳定性较差。如何利用多组学的进行优势互补,尽早识别癌症患者,灵敏地监测疾病动态变化,是液体活检中一个亟待解决的问题。

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